Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cacna1sQ02789 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna1sQ02789 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1sQ02789 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1sQ02789 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms