Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gja5Q01231 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gja5Q01231 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gja5Q01231 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja5Q01231 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja5Q01231 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms