Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cited1P97769 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited1P97769 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited1P97769 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms