Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarcc1P97496 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc1P97496 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarcc1P97496 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms