Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf1bP97358 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Taf1bP97358 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms