Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct3P80318 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct3P80318 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct3P80318 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cct3P80318 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cct3P80318 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct3P80318 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms