Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad1P70340 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad1P70340 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad1P70340 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad1P70340 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad1P70340 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad1P70340 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms