Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp7P70280 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms