Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkn1P70268 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkn1P70268 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkn1P70268 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms