Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcbP68404 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcbP68404 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms