Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl8P62918 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl8P62918 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms