Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23P62830 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms