Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm5P62322 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm5P62322 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm5P62322 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms