Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Siah1aP61092 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Siah1aP61092 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Siah1aP61092 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms