Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ActbP60710 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ActbP60710 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ActbP60710 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ActbP60710 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ActbP60710 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ActbP60710 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ActbP60710 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ActbP60710 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ActbP60710 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ActbP60710 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ActbP60710 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ActbP60710 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ActbP60710 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ActbP60710 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ActbP60710 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ActbP60710 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ActbP60710 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ActbP60710 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ActbP60710 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ActbP60710 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms