Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c38P56655 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c38P56655 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c38P56655 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms