Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn5P54830 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn5P54830 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptpn5P54830 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn5P54830 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn5P54830 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms