Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PctpP53808 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PctpP53808 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PctpP53808 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PctpP53808 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PctpP53808 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PctpP53808 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PctpP53808 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PctpP53808 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PctpP53808 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PctpP53808 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PctpP53808 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PctpP53808 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PctpP53808 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PctpP53808 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PctpP53808 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PctpP53808 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PctpP53808 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PctpP53808 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PctpP53808 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PctpP53808 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PctpP53808 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PctpP53808 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PctpP53808 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PctpP53808 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PctpP53808 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PctpP53808 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PctpP53808 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PctpP53808 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PctpP53808 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PctpP53808 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PctpP53808 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PctpP53808 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PctpP53808 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PctpP53808 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PctpP53808 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PctpP53808 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PctpP53808 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PctpP53808 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PctpP53808 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PctpP53808 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PctpP53808 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PctpP53808 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms