Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CebpaP53566 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CebpaP53566 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CebpaP53566 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CebpaP53566 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CebpaP53566 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CebpaP53566 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CebpaP53566 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CebpaP53566 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpaP53566 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms