Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FanccP50652 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FanccP50652 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FanccP50652 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FanccP50652 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FanccP50652 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FanccP50652 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FanccP50652 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FanccP50652 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FanccP50652 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FanccP50652 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FanccP50652 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FanccP50652 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FanccP50652 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FanccP50652 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FanccP50652 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FanccP50652 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FanccP50652 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FanccP50652 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FanccP50652 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FanccP50652 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FanccP50652 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FanccP50652 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FanccP50652 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FanccP50652 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FanccP50652 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FanccP50652 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FanccP50652 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FanccP50652 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FanccP50652 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FanccP50652 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FanccP50652 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FanccP50652 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FanccP50652 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FanccP50652 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FanccP50652 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FanccP50652 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FanccP50652 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FanccP50652 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FanccP50652 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FanccP50652 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FanccP50652 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FanccP50652 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FanccP50652 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FanccP50652 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FanccP50652 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms