Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnni3P48787 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnni3P48787 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms