Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx2P48379 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx2P48379 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms