Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ItgavP43406 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgavP43406 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgavP43406 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ItgavP43406 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgavP43406 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgavP43406 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgavP43406 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms