Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sept1P42209 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sept1P42209 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept1P42209 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept1P42209 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept1P42209 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sept1P42209 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept1P42209 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept1P42209 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept1P42209 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept1P42209 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept1P42209 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms