Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3rP40223 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Csf3rP40223 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms