Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppm1bP36993 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppm1bP36993 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms