Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbxas1P36423 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbxas1P36423 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbxas1P36423 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms