Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx2P30658 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx2P30658 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx2P30658 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx2P30658 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms