Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnd3P30282 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccnd3P30282 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms