Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxraP28700 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxraP28700 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxraP28700 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxraP28700 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxraP28700 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxraP28700 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxraP28700 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RxraP28700 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxraP28700 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxraP28700 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxraP28700 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxraP28700 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxraP28700 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxraP28700 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxraP28700 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxraP28700 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxraP28700 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxraP28700 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxraP28700 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxraP28700 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxraP28700 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxraP28700 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxraP28700 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RxraP28700 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RxraP28700 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RxraP28700 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RxraP28700 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RxraP28700 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxraP28700 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RxraP28700 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RxraP28700 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RxraP28700 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxraP28700 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxraP28700 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxraP28700 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RxraP28700 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxraP28700 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxraP28700 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RxraP28700 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RxraP28700 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxraP28700 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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