Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa5P28312 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa5P28312 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms