Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-DMaP28078 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-DMaP28078 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms