Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav1P27870 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav1P27870 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav1P27870 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vav1P27870 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav1P27870 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vav1P27870 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav1P27870 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vav1P27870 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms