Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2af2P26369 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af2P26369 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af2P26369 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af2P26369 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms