Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkchP23298 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkchP23298 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkchP23298 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkchP23298 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkchP23298 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkchP23298 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkchP23298 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkchP23298 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkchP23298 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkchP23298 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkchP23298 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms