Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TP20293 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP20293 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TP20293 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP20293 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP20293 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TP20293 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TP20293 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TP20293 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TP20293 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TP20293 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TP20293 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TP20293 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TP20293 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TP20293 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TP20293 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TP20293 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TP20293 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TP20293 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP20293 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP20293 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP20293 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP20293 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP20293 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP20293 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP20293 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP20293 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TP20293 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP20293 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP20293 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP20293 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP20293 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP20293 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP20293 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP20293 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP20293 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TP20293 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP20293 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP20293 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TP20293 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TP20293 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TP20293 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TP20293 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TP20293 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TP20293 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TP20293 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TP20293 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TP20293 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms