Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnc1P19123 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms