Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp53P15975 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp53P15975 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp53P15975 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp53P15975 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp53P15975 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp53P15975 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp53P15975 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp53P15975 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp53P15975 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp53P15975 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms