Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rag1P15919 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rag1P15919 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rag1P15919 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rag1P15919 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms