Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccl4P14097 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccl4P14097 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms