Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1P13405 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1P13405 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1P13405 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1P13405 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1P13405 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms