Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsbP10605 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsbP10605 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsbP10605 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsbP10605 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsbP10605 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsbP10605 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms