Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c2P0CW03 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c2P0CW03 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms