Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxb2P0C1T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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