Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pgk2P09041 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pgk2P09041 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pgk2P09041 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms