Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd3P09027 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd3P09027 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms