Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrlP06879 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrlP06879 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrlP06879 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrlP06879 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrlP06879 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrlP06879 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrlP06879 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrlP06879 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrlP06879 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrlP06879 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrlP06879 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrlP06879 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrlP06879 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrlP06879 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrlP06879 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrlP06879 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrlP06879 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrlP06879 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrlP06879 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrlP06879 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrlP06879 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrlP06879 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrlP06879 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrlP06879 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrlP06879 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrlP06879 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrlP06879 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrlP06879 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrlP06879 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrlP06879 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrlP06879 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrlP06879 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrlP06879 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrlP06879 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrlP06879 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrlP06879 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrlP06879 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrlP06879 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrlP06879 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrlP06879 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrlP06879 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrlP06879 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrlP06879 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrlP06879 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrlP06879 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrlP06879 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrlP06879 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrlP06879 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrlP06879 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrlP06879 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrlP06879 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrlP06879 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrlP06879 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrlP06879 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrlP06879 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms