Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnfP06804 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnfP06804 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnfP06804 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnfP06804 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TnfP06804 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TnfP06804 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TnfP06804 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TnfP06804 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TnfP06804 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TnfP06804 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TnfP06804 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TnfP06804 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TnfP06804 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TnfP06804 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TnfP06804 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TnfP06804 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TnfP06804 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TnfP06804 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TnfP06804 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TnfP06804 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TnfP06804 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TnfP06804 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TnfP06804 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TnfP06804 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TnfP06804 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TnfP06804 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TnfP06804 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TnfP06804 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TnfP06804 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TnfP06804 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TnfP06804 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TnfP06804 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnfP06804 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnfP06804 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnfP06804 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnfP06804 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TnfP06804 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TnfP06804 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TnfP06804 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnfP06804 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnfP06804 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnfP06804 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnfP06804 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnfP06804 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms