Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lamc1P02468 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lamc1P02468 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Lamc1P02468 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms