Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01741 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01741 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01741 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01741 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01741 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01741 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01741 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01741 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01741 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01741 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01741 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01741 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01741 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01741 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms